Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RtcbQ99LF4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RtcbQ99LF4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms