Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ciao1Q99KN2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms