Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp11Q99K46 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp11Q99K46 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms