Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Derl1Q99J56 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms