Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Cldn16Q925N4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Cldn16Q925N4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Cldn16Q925N4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Cldn16Q925N4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Cldn16Q925N4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Cldn16Q925N4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Cldn16Q925N4 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Cldn16Q925N4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cldn16Q925N4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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