Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smc1bQ920F6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smc1bQ920F6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smc1bQ920F6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smc1bQ920F6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smc1bQ920F6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smc1bQ920F6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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