Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Med28Q920D3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med28Q920D3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms