Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Atl3Q91YH5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atl3Q91YH5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms