Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx15Q91WE1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snx15Q91WE1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snx15Q91WE1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snx15Q91WE1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snx15Q91WE1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snx15Q91WE1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx15Q91WE1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms