Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klc3Q91W40 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms