Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp3Q91W36 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp3Q91W36 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms