Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sh3bgrl3Q91VW3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms