Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rhbdd2Q8VEK2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rhbdd2Q8VEK2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rhbdd2Q8VEK2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms