Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Vmn1r200Q8R281 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Vmn1r200Q8R281 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r200Q8R281 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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