Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Abcf3Q8K268 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Abcf3Q8K268 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Abcf3Q8K268 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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