Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Upp2Q8CGR7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms