Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms