Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp27Q8CEG8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp27Q8CEG8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp27Q8CEG8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp27Q8CEG8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Usp27Q8CEG8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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