Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hdac7Q8C2B3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Hdac7Q8C2B3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Hdac7Q8C2B3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Hdac7Q8C2B3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Hdac7Q8C2B3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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Hdac7Q8C2B3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hdac7Q8C2B3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hdac7Q8C2B3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
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Hdac7Q8C2B3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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