Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Znf428Q8C1M2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Znf428Q8C1M2 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Znf428Q8C1M2 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Znf428Q8C1M2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Znf428Q8C1M2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Znf428Q8C1M2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Znf428Q8C1M2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Znf428Q8C1M2 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms