Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Atg16l1Q8C0J2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Atg16l1Q8C0J2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Atg16l1Q8C0J2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg16l1Q8C0J2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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