Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ube3dQ8BX13 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ube3dQ8BX13 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ube3dQ8BX13 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ube3dQ8BX13 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ube3dQ8BX13 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ube3dQ8BX13 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ube3dQ8BX13 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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