Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod1Q8BVA4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod1Q8BVA4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod1Q8BVA4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod1Q8BVA4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod1Q8BVA4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod1Q8BVA4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod1Q8BVA4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod1Q8BVA4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod1Q8BVA4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod1Q8BVA4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod1Q8BVA4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod1Q8BVA4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms