Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp1Q8BJQ2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms