Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cyp4f39Q8BGU0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cyp4f39Q8BGU0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cyp4f39Q8BGU0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cyp4f39Q8BGU0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Cyp4f39Q8BGU0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cyp4f39Q8BGU0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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