Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms