Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms