Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NischQ80TM9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NischQ80TM9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
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