Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ClmQ7TSN2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms