Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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