Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vstm2lQ6PDS0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms