Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrimpolQ6P1E7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms