Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
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