Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg9bQ6EBV9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9bQ6EBV9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms