Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlh2Q64221 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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