Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sema3cQ62181 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sema3cQ62181 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms