Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RhocQ62159 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
RhocQ62159 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RhocQ62159 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms