Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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BcanQ61361 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BcanQ61361 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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BcanQ61361 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BcanQ61361 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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BcanQ61361 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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BcanQ61361 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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BcanQ61361 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BcanQ61361 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms