Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SynrgQ5SV85 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms