Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TefmQ5SSK3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms