Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Trappc1Q5NCF2 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Trappc1Q5NCF2 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Trappc1Q5NCF2 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Trappc1Q5NCF2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Trappc1Q5NCF2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Trappc1Q5NCF2 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Trappc1Q5NCF2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Trappc1Q5NCF2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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Trappc1Q5NCF2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Trappc1Q5NCF2 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Trappc1Q5NCF2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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Trappc1Q5NCF2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
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Trappc1Q5NCF2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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