Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shank3Q4ACU6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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