Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Lrrc43Q3V0L5 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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Lrrc43Q3V0L5 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Lrrc43Q3V0L5 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Lrrc43Q3V0L5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc43Q3V0L5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc43Q3V0L5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Lrrc43Q3V0L5 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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