Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYK3

Tbc1d9, TBC1 domain family member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9Q3UYK3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tbc1d9Q3UYK3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tbc1d9Q3UYK3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms