Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rmi2Q3UPE3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms