Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp19Q3UJD6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms