Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx27Q3UHD6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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