Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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