Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Shcbp1lQ3TTP0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Shcbp1lQ3TTP0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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