Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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